He estado investigando un poco en la web, que ventajas o que inconvenientes tiene realizar flexo-extensión de rodilla (o comúnmente sentadilla) bajando hasta el final del todo o hasta que tu cadera esté a 90º respecto al cuerpo (media sentadilla). La conclusión final es que es lesivo realizar la sentadilla completa, ya que hay mayor momento en la rodilla, por lo que se traduce en una mayor carga. Esto puede tener unas consecuencias a largo plazo en los meniscos y ligamentos. En cuanto a rendimiento, parecen que ambas producen el mismo efecto eléctrico en la articulación, sin embargo, hay una mayor trabajo de glúteo haciéndolas profundas. Os dejo el link de la pagina donde lo he mirado y la referencia bibliográfica de otro estudio que he mirado. Un abrazo!
Escamilla RF. Knee biomechanics of the dynamic squat exercise. Met sci sport exerc, 2001; 33:127-141